K nejcennějším chráněným územím patří pralesní rezervace Beskyd, největší chráněné krajinné oblasti u nás. Příkladem může být národní přírodní rezervace Kněhyně-Čertův mlýn, Makyta-Valašská Kyčera nebo Razula s nejstaršími jedlemi 300-350 let starými. Ukázkou překrásné bučiny Bílých Karpat je přírodní rezervace Sidonie poblíž Brumova-Bylnice a opomenout nelze ani jednu z nejstarších pralesních rezervací na Moravě – Javořinu. Ze zajímavých chřibských lokalit můžeme vzpomenout například přírodní rezervaci Smutný žleb nebo Záskalí. Jedním z nejkrásnějších příkladů jedlové bučiny v Hostýnských vrších je přírodní rezervace Tesák se stromy starými až 180 let nebo přírodní památka Bernátka. Přírodní rezervace Čerňava v Hostýnských vrších je ukázkou zachovalého typického karpatského lesa pralesovitého charakteru s jednotlivými stromy až 280 let starými. Zcela odlišné prostředí nabízejí vyprahlé lesostepní partie Pálavy a komplex lužních lesů na Soutoku, které jsou součástí biosférické rezervace UNESCO Dolní Morava.
Zvláštním fenoménem jsou květnaté orchideové louky biosférické rezervace Bílé Karpaty. Největší komplex tohoto typu se nachází v Národní přírodní rezervace Čertoryje, menší pak v rezervacích Lazy, Jalovcová stráň, Ploščiny, Bílé Potoky a Javorůvky. Podobně Galovské lúky představují jednu z nejvýznamnějších enkláv horských luk v Javorníkách s početnou populací vstavačů a jedna z nejbohatších lokalit vstavačovitých na Moravě se nachází v národní přírodní rezervaci Strabišov-Oulehla.
Po krásách horských lesů a luk vede celá řada naučných stezek.